По результатам крупномасштабного анализа данных из Атласа генома рака (The Cancer Genome Atlas), идентифицировано 37 молекул РНК в качестве возможных предикторов выживаемости больных с наиболее распространенной формой рака молочной железы.
Учеными из Центра всестороннего изучения рака в Университете штата Огайо (Ohio State University Comprehensive Cancer Center) проведен анализ данных экспрессии матричной РНК (мРНК) и микро-РНК, ДНК-метилирования, а также клинических данных 466 пациенток с диагностированным инвазивным протоковым раком молочной железы — наиболее распространенной формой данной онкологической патологии.
Идентифицировано 30 мРНК и 7 микро-РНК (короткие отрезки РНК), которые устойчиво ассоциировались с клиническими исходами (общей выживаемостью) по 44 клиническим и молекулярным подклассам, включая ранние стадии рака. По результатам оценки прогностической достоверности РНК-маркера с использованием данных геномной экспрессии у 2399 пациенток с диагностированным раком молочной железы в 8 когортах выявлена более высокая прогностическая достоверность мРНК и микро-РНК, чем у других РНК-маркеров, используемых для стратификации риска у больных раком молочной железы.
Впервые в оценке прогноза клинических исходов как рака молочной железы, так и других форм рака использован комбинированный РНК-маркер — мРНК и микро-РНК. По мнению ученых, такой короткий РНК-маркер окажется полезным в организации оптимального ведения больных онкологического профиля.
Как выяснилось, большинство генов, входящих в новый прогностический РНК-маркер, ранее не связывали с развитием рака молочной железы, кроме того, в отличие от многих других прогностических РНК-маркеров, он не содержит гены, вовлеченные в цикл дифференцированного клеточного роста опухоли.
Большинство вновь выявляемых прогностических генов становятся новой мишенью для лекарственного воздействия, они также являются генами с неизвестными функциями и требуют дальнейшего изучения. Кроме того, эти гены могут быть предметом лабораторных исследований в качестве детекторов ранних стадий рака.
Основные ключевые выводы по результатам исследования могут быть представлены следующим образом:
- идентифицированный РНК-маркер может быть предиктором ответа на специфическую терапию, а также применяться в качестве прогностического маркера выживаемости;
- метод ДНК-метилирования использован для подтверждения ассоциации РНК-экспрессии и общей выживаемости;
- маркер включает мутации в участке генома PIK3CA, указывая тем самым значимость отрезка PIK3CA/AKT2/PTEN как независимого прогностического кофактора;
- прогностическая ценность интегрированного маркера была наивысшей в ранних (I–II) стадиях рака молочной железы, что предполагает его эффективное применение в клинической практике в качестве ценного прогностического биомаркера.
Ohio State University Medical Center (2013) Big data analysis identifies prognostic RNA markers in a common form of breast cancer. ScienceDaily, April 30 (www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130429154109.htm).
Volinia S., Croce C.M. (2013) Prognostic microRNA/mRNA signature from the integrated analysis of patients with invasive breast cancer. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., Apr. 15 [Epub ahead of print].
Ольга Федорова
